Кіста хребта в попереково-крижовому або іншому відділі може викликати такі ускладнення: порушення рухливості та чутливості пошкодження міжхребцевих дисків
Відсутність лікування призводить до деформації міжхребцевих дисків, розвитку викривлень хребетного стовпа, дегенеративно-дистрофічних змін хребта, гнійних наривів, абсцесу та можливого сепсису.
Біль у хребті відчувається як у спокої, і під час руху. Можливий головний біль та запаморочення, шум у вухах (Такі симптоми, найчастіше, пов'язані з арахноїдальними кістами). Порушення чутливості (відчуття мурашок, поколювання, оніміння рук та/або ніг, пальців).
Операція з видалення кісти хребта вважається єдиним ефективним методом лікування на запущених стадіях захворювання, коли йдеться про параартикулярну синовіальну кисті міжхребцевого фасеткового суглоба