МРТ головного мозку без контрастного посилення – найінформативніший метод діагностики внутрішньочерепних патологій: травми головного мозку, підозри на пухлину, порушення мозкового кровообігу, вроджені аномалії, захворювання лор-органів
Таким чином, головне, чим відрізняється МРТ головного мозку – це можливість діагностувати пухлини та ураження нервових тканин, а МРТ судин головного мозку – можливістю досліджувати циркуляцію крові та кровопостачання тканин. Як той, так і інший вид МРТ може проводитися з використанням контрастної речовини.
У цілому нині, МРТ краще розрізняє м'які тканини. Кістки при цьому не можуть бути видно – резонанс від кальцію відсутня і кісткова тканина на МР-томограм видно лише опосередковано.