Після першого сеансу мануальної терапії виникнення больового синдрому на місці дії – зустрічається у 20% пацієнтів, пов'язана із значною зміною рухового стереотипу та зазвичай регресує до закінчення 1х діб після сеансу.
До ускладнень, які можуть спостерігатися після проведення сеансу мануальної терапії, належать: Збільшення хворобливості у зоні впливу. Це зазвичай буває при надмірно активно проведеній процедурі із застосуванням великої сили або багаторазовому повторенні однотипних вправ. Поява м'язового спазму.
Категорично заборонені: широкі помахи руками, різкі рухи; відвідування лазні, сауни, прийняття гарячої ванни; не рекомендується керування автомобілем після сеансу.