Класифікують екологічну, етологічну, тимчасову, анатомо-морфо-фізіологічну та генетичну репродуктивну ізоляції.
Існує кілька форм репродуктивної ізоляції. предзиготична (перешкоджає запліднення), постзиготична (перешкоди гібридизації), розсіяні в геномі повтори.
Якщо між популяціями виникає ізоляція, то згодом у них накопичуються відмінності, які перешкоджають вільному схрещуванню особин. В результаті популяції (генетично відкриті системи) стають новими видами (генетично закритими системами).
Біологічна ізоляція не має фізичних перешкод між двома частинами популяції, географічна має. Наприклад, гора або водоймище.