Лікування комплексного посттравматичного стресового розладу зазвичай включає всі елементи стандартного лікування ПТСР: психотерапію (переробка десенсибілізації рухів очей та орієнтована на травму когнітивно-поведінкова терапія) та медикаментозну терапію.
Як ефективні методи лікування КПТСР виділені: когнітивно-поведінкова терапія, десенсибілізація та переробка рухів очей (EMDR), тілесно-орієнтована терапія та арт-терапія.
В даний час при лікуванні ПТСР використовується психотерапія («розмовна» терапія), ліки або медикаментозно-терапевтична комбінація.
Найчастіше рекомендуються селективні інгібітори зворотного захоплення серотоніну та інші антидепресанти, такі як міртазапін та венлафаксин.. Для лікування безсоння та кошмарів лікарі іноді призначають такі препарати, як оланзапін та кветіапін (також застосовуються як антипсихотичні препарати).