Найчастіше спостерігаються ерозивно-виразкові ураження шлунково-кишкового тракту (ЖКТ), особливо слизової оболонки шлунка – НПЗП-гастропатія.
Аналгетичний, жарознижувальний та протизапальний ефекти НПЗЗ обумовлені інгібуванням ЦОГ 2, тоді як побічні дії ( ульцерогенний, розвиток геморагічного синдрому, бронхоспазму та ін..) обумовлені інгібуванням ЦОГ 1.
Загальний для всіх НПЗП побічний ефект – пошкодження слизової оболонки шлунково-кишкового тракту. Тому препарати протипоказані при виразковій хворобі шлунка та дванадцятипалої кишки, гастроезофагеальному рефлюксі та інших захворюваннях шлунково-кишкового тракту. Найчастіші побічні ефекти НПЗЗ – печія та діарея.