Мігрень дуже чутлива до коливань рівня жіночих статевих гормонів. Перед початком менструації різко знижується рівень естрогенів. Це запускає розвиток нападу.
Як естроген, так і прогестерон впливають на поширювану кіркову депресію (РКД), що лежить в основі розвитку нападу мігрені. Вплив обох гормонів призводить до збільшення частоти, так і амплітуди РКД, тоді як вплив тільки естрогену знижує поріг виникнення РКД.
Головний біль може бути викликаний зміною рівня естрогену, зокрема при його зниженні під час менструації. Жінки можуть також відчувати головний біль на початку менопаузи і в тому випадку, коли вони піддаються гістеректомії (видалення матки).
Виявилося, що у жінок з мігренню рівень естрогену після досягнення піку знижувався на 40%, а у учасниць без цієї патології – на 30%. Причому істотних відмінностей у зміні інших гормонів немає. Вчені зробили висновок, що рівень естрогену безпосередньо впливає на ризик розвитку мігрені.