Ібупрофен при болях у шлунку не застосовується. Навпаки, у протипоказаннях до препарату є патології шлунково-кишкового тракту, що супроводжуються больовим синдромом: виразка шлунка і 12-палої кишки; неспецифічний виразковий коліт (хвороба Крона)
НПЗЗ, блокуючи синтез ЦОГ-1, можуть призводити до пошкодження слизової оболонки шлунка та кишечника та порушення агрегації тромбоцитів.. Таким чином, НПЗЗ збільшують ризик розвитку таких тяжких шлунково-кишкових захворювань, як запалення, кровотеча та пенетрація шлунка чи кишечника.
Не рекомендується довго вживати його тим, хто має проблеми зі шлунком: ібупрофен здатний посилити виразкову хворобу та ураження слизової шлунка. Якщо приймати ібупрофен із їжею або після їди, цей ризик можна зменшити. Можливі внутрішні кровотечі – правда, це дуже рідкісні випадки.
Ібупрофен також показаний як знеболюючого засоби для усунення слабкого та помірного больового синдрому при таких станах, як дисменорея, зубний або післяопераційний біль, для симптоматичного полегшення головного болю, у тому числі мігрені.