Біль обумовлена тим, що у вогнищах ендометріозу відбуваються циклічні розлади, подібні до тих, що відбуваються в ендометрії, а також супутніми запальними порушеннями, змінами в нервових закінченнях і спайковим процесом, в який нерідко залучені нижні відділи кишечника.
Так, найбільш характерними ознаками ендометріозу є: Болі внизу живота, не пов'язані з менструацією, іррадіація болів у поперек та куприк Болі під час статевого акту Кров'янисті виділення зі статевих шляхів до та після менструації Безпліддя
Щоб уникнути розвитку ускладнень при ендометріозі не рекомендується надмірна теплова дія на організм (відвідування бань та саун), а також відвідування солярію та цілеспрямоване тривале перебування під відкритими сонячними променями на курортах. Також не можна приймати гарячі ванни.
Найчастіше болі при ендометріозі локалізуються внизу живота і поширюються в область попереку та тазухоча це залежить від розташування первинних ендометріоїдних вогнищ. Інтенсивність больових проявів залежить від багатьох факторів, зокрема від порога чутливості жінки.