Альфа-мотонейрони, що іннервують голову і шию розташовуються в стовбурі головного мозку; α-МН, що іннервують інше тіло, розташовуються в спинному мозку.
Гамма-мотонейрони (γ-мотонейрони) – дрібні клітини (діаметр 30-40 мкм), розташовані в дев'ятій пластині сірої речовини спинного мозку та розсіяні серед альфа-мотонейронів.
Основні мотонейрони, що забезпечують свідомі рухи, лежать у шар V прецентральної звивини і є гігантські пірамідальні клітини, званими клітинами Беца. Клітинні тіла цих нейронів є найбільшими у мозку, досягаючи майже 0,1 мм у діаметрі.
Рухові нейрони поділяють на центральні та периферичні за їх локалізації в організмі. Відповідно, центральні рухові клітини знаходяться в спинному та головному мозку, а периферичні. безпосередньо у м'язах та приєднуються до них через аксони нейронів.