Одночасний прийом сертраліну в дозі 200 мг на добу не потенціює ефекти алкоголю, карбамазепіну, галоперидолу або фенітоїну на когнітивну та психомоторну функцію у здорових людей; Проте слід уникати одночасного прийому сертраліну та алкоголю.
Антидепресанти (ці препарати містять у своєму складі інгібітори моноаміноксидази), тому з ними краще не поєднувати витримані сири, сири з пліснявою, квашену капусту, соєвий соус, яловичу та курячу печінку, в'ялену рибу та м'ясо, йогурти, інжир, родзинки та сметану.
Не рекомендується одночасне застосування із сертраліном: Етанол. Незважаючи на те, що при одночасному застосуванні сертраліну не відмічено потенціювання ефекту етанолу, вживання спиртних напоїв та препаратів, що містять алкоголь, під час лікування сертраліном не рекомендується.
Сертралін зв'язується із білками плазми крові. Тому необхідно враховувати можливість його взаємодії з іншими препаратами, що зв'язуються з білками (наприклад, з діазепамом, толбутамідом та варфарином). При одночасному застосуванні з циметидином спостерігається значне зменшення кліренсу сертраліну.