Пароксетін не слід призначати одночасно з інгібіторами МАО, включаючи лінезолід — антибіотик, який є зворотним неселективним інгібітором МАО та метилтіоніну хлориду (метиленового синього), і раніше, ніж через 2 тижні після припинення лікування інгібіторами МАО (див. ВЗАИМОДІЙ3.
Пароксетін не слід застосовувати у комбінації з тіоридазином, оскільки, як і інші препарати, що пригнічують активність печінкового ізоферменту CYP2D6, пароксетин може підвищувати концентрації тіоридазину в плазмі, що може призвести до подовження інтервалу QTc і пов'язаної з цим шлуночкової аритмії типу «пірует», …
Не радять експерти також змішувати антидепресанти та знеболювальні. Згідно з дослідженням голландських учених, поєднання цих препаратів може спричинити шлунково-кишкову кровотечу. Також не рекомендується одночасно приймати заспокійливі та знеболювальні ліки.
Рекомендується бути обережним при застосуванні пароксетину у пацієнтів з тяжким ступенем порушення функції нирок або пацієнтів з порушеннями функції печінки. Як і інші антидепресанти, пароксетин слід застосовувати з обережністю у пацієнтів з епілепсією.