Зазвичай курс лікування займає не менше 21-28 днів. Якщо є симптоми фунікулярного мієлозу (парестезії – оніміння кінцівок), вітамін В12 вводиться у великій дозі щодня протягом щонайменше 10 днів. Потім доза зменшується, а курс терапії доповнюється вітаміном В1 по 100 мкг на добу.
При анеміях, пов'язаних з дефіцитом вітаміну B12, вводять по 100-200 мкг за день. При анемії з явищами фунікулярного мієлозу та при макроцитарних анеміях із захворюваннями нервової системи – по 400-500 мкг у перші 7 днів щодня, потім 1 раз на 5-7 днів.
При більш тяжкому дефіциті вітамін B12 призначається внутрішньом'язово у дозі 1 мг. 1–4 рази/тиждень протягом кількох тижнів до нормалізації гематологічних тестів; після цього він вводиться 1 раз на місяць.
Цей вітамін може накопичуватися і є нетоксичним, тому доцільно пити або колоти його не завжди, а курсами.