Служить передачі нервового імпульсу між двома клітинами, причому під час синаптичної передачі амплітуда і частота сигналу можуть регулюватися. Передача імпульсів здійснюється хімічним шляхом за допомогою медіаторів або електричним шляхом за допомогою проходження іонів з однієї клітини в іншу.
Залежно від природи медіатора розрізняють такі хімічні синапси: холінергічні (медіатор – ацетилхолін), адренергічні (нарадреналін), дофамінергічні (дофамін), ГАМК-ергічні (гама-аміномасляна кислота) і т. д. За функціональним ефектом синапси можуть бути збуджуючими та гальмуючими.
Існує кілька класифікацій синапсів. По локалізації: 1) центральні синапси; 2) периферичні синапси. Центральні синапси лежать у межах центральної нервової системи, а також знаходяться в гангліях вегетативної нервової системи.
Синапси утворені мембранами двох контактуючих клітин, пресинаптичної та постсинаптичної, які розділені вузькою синаптичною щілиною. Медіатор виділяється в синаптичну щілину за рахунок зкзоцитозу, дифундує до рецепторів постсинаптичної мембрани, зв'язується з ними та передає сигнал сусідній клітині.