При мізофонії основним методом лікування є психотерапія. У першому етапі з'ясовують причину, через яку певні звуки викликають настільки загострену емоційну реакцію. Далі – впливають на цю причину за допомогою когнітивно-поведінкової терапії у поєднанні зі звуковою терапією.
Гіперакузія – це розлад слухового апарату, через який звуки викликають невідповідну реакцію сприйняття, відчуваються болісно, голосніше і неприємніше, ніж вони є насправді. При цьому звуки необов'язково самі по собі повинні бути надто гучними, неприємними чи дратівливими.
У людей із мізофонією надто активно працює фронтальна частина острівцевої кори головного мозку — ділянка, яка відповідає за зв'язок між фізичними відчуттями та емоціями. При цій дисфункції мозку звичайнісінькі звуки викликають емоційну реакцію — гнів, паніку, страх, стрес та істерики.