Складається із трьох основних частин: нервового закінчення з пресинаптичною мембраною, постсинаптичної мембрани клітини-мішені та синаптичної щілини між ними.
Сінапси утворені мембранами двох контактуючих клітин, пресинаптичної та постсинаптичної, які розділені вузькою синаптичною щілиною.. Медіатор виділяється в синаптичну щілину за рахунок зкзоцитозу, дифундує до рецепторів постсинаптичної мембрани, зв'язується з ними та передає сигнал сусідній клітині.
Сінапси складаються з трьох основних елементів: пресинаптичної мембрани, постсинаптичної мембрани та синаптичної щілини (Рис. 1). Деякі елементи синапсів можуть мати інші назви.
За морфологічним принципом синапси поділяють на: нейром'язові (аксон нейрона контактує з м'язовою клітиною); нейросекреторні (аксон нейрона контактує з секреторною клітиною); нейро-нейрональні (аксон нейрона контактує з іншим нейроном):