Звіробій може підвищувати чутливість до сонячного світла. Інші побічні ефекти включають сухість у роті, запор, стомлюваність, дезорієнтацію та, у осіб із біполярним розладом, розвиток манії.
Застосовуючи звіробій, слід пам'ятати, що у його складі є отруйні речовини, які у великих кількостях можуть значно посилювати світлочутливість, сприяють підвищенню артеріального тискутому він протипоказаний при гіпертонічній хворобі.
Можлива: алергічні реакції. При тривалому застосуванні можливі неприємні відчуття в області печінки, відчуття гіркоти в роті, у деяких випадках при прийомі внутрішньо – фотосенсибілізуюча дія (підвищена чутливість шкіри до дії сонячного світла).
Настій трави звіробою не можна приймати внутрішньо. при вагітності та в період лактації.