Системний аналіз використовують для з'ясування причин існуючих складнощів, постановки цілей, вироблення методів та варіантів усунення проблем. Він виступає у ролі організатора та координатора.
Основна мета системного аналізу – пошук шляхів виходу з проблемної ситуації в предметній галузі, що розглядається.. Внаслідок здійснення процедур системного аналізу отримують методологію вирішення складних проблем.
Системний аналіз застосовується, щоб слабо структурувати неструктуровану проблему, потім зібрати додаткову інформацію про неї, встановити взаємозв'язки складових, дати кількісні оцінки (хоч би суб'єктивні, експертні) та перекласти проблему у розряд структуризованих, до вирішення яких уже можна застосувати…
Головним завданням системного аналізу є вирішення проблемної ситуації, що виникла перед об'єктом проведеного системного дослідження.