Піридоксин призначають внутрішньовенно, внутрішньом'язово або підшкірно (якщо прийом внутрішньо неможливий, наприклад, при блювоті та при порушенні всмоктування в кишечнику). Дорослим лікувальні дози становлять 50-100 мг (1-2 мл 5% розчину), 1-2 рази на добу. Курс лікування становить 1-2 місяці. Дітям – по 20 мг, курс лікування – 2 тижні.
Схема лікування має такий вигляд: Для профілактики анемії та авітамінозу – від 200 до 500 мкг на добу. Курс лікування становить від 7 до 15 днів.
Добова потреба у піридоксині для дорослих – 2–2,5 мг. Для жінок – 2 мг та додатково при вагітності 0,3 мг, при годуванні груддю – 0,5 мг. При тяжких ураженнях печінки піридоксин у великих дозах може спричинити погіршення її функції.