Лікування можливе лише хірургічним шляхом. Однак більшість кіст не потребують активного лікування, оскільки мають малий розмір і не прогресують у розмірі. Щодо них проводиться регулярне динамічне спостереження за допомогою МРТ або КТ-контролю.
Хірургічне лікування показано у разі швидкого зростання кісти та ризику розвитку ускладнень на фоні впливу на структури головного мозку. Суть хірургічного лікування полягає у дренуванні кісти, при цьому використовується ендоскопічне обладнання.
Причинами кісти головного мозку у дитини та дорослих людей можуть бути перенесені інфекційні захворювання, травми голови, запальні процеси, аномалії внутрішньоутробного розвитку, порушення мозкового кровообігу з утворенням некрозу та ішемії.