Електричні синапси зустрічаються по всій центральній нервовій системі.
Залежно від природи медіатора розрізняють такі хімічні синапси: холінергічні (медіатор – ацетилхолін), адренергічні (нарадреналін), дофамінергічні (дофамін), ГАМК-ергічні (гама-аміномасляна кислота) і т. д. За функціональним ефектом синапси можуть бути збуджуючими та гальмуючими.
Найбільш поширені хімічні синапси. Для нервової системи ссавців електричні синапси менш характерні, ніж хімічні.
Існує кілька класифікацій синапсів. По локалізації: 1) центральні синапси; 2) периферичні синапси. Центральні синапси лежать у межах центральної нервової системи, а також знаходяться в гангліях вегетативної нервової системи.