ЕЕГ виявляє наявність органічних ушкоджень різних структур мозку, що виникли в період пренатального та постнатального розвитку, які можуть зумовити порушення уваги, поведінки, емоційно-вольової сфери, мовної діяльності.
невротичні прояви та нав'язливості (нав'язливі рухи, тики, заїкуватість, енурез); порушення поведінки у дітей (розгальмованість, непосидючість, підвищена відволікання, розлади нічного сну); психопатії та розлади особи; затримки психічного та психомоторного розвитку.
Аналіз біоелектричної активності головного мозку за допомогою ЕЕГ спокою найбільш простий та доступний метод дослідження у дітей з аутизмом. Спектральний аналіз ЕЕГ дозволяє виявити області з переважанням тієї чи іншої форми активності, що відображають баланс процесів збудження та гальмування.
Електроенцефалограма реєструє електричні сигнали клітин головного мозку та дозволяє виявити епілепсію, травми, новоутворення, запальні процеси, зміни в судинах.